Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IFIH1Q9BYX4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
IFIH1Q9BYX4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IFIH1Q9BYX4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IFIH1Q9BYX4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFIH1Q9BYX4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IFIH1Q9BYX4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFIH1Q9BYX4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
IFIH1Q9BYX4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFIH1Q9BYX4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFIH1Q9BYX4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IFIH1Q9BYX4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
IFIH1Q9BYX4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IFIH1Q9BYX4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IFIH1Q9BYX4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFIH1Q9BYX4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFIH1Q9BYX4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFIH1Q9BYX4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFIH1Q9BYX4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFIH1Q9BYX4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFIH1Q9BYX4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFIH1Q9BYX4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms