Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BCO2Q9BYV7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCO2Q9BYV7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCO2Q9BYV7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BCO2Q9BYV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCO2Q9BYV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCO2Q9BYV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCO2Q9BYV7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCO2Q9BYV7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCO2Q9BYV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCO2Q9BYV7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCO2Q9BYV7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCO2Q9BYV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BCO2Q9BYV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BCO2Q9BYV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCO2Q9BYV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCO2Q9BYV7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCO2Q9BYV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCO2Q9BYV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
BCO2Q9BYV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms