Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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