Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL1Q9BYD6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL1Q9BYD6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL1Q9BYD6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRPL1Q9BYD6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL1Q9BYD6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL1Q9BYD6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MRPL1Q9BYD6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MRPL1Q9BYD6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPL1Q9BYD6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL1Q9BYD6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL1Q9BYD6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL1Q9BYD6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms