Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM5DQ9BY66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM5DQ9BY66 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
KDM5DQ9BY66 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM5DQ9BY66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM5DQ9BY66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM5DQ9BY66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5DQ9BY66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KDM5DQ9BY66 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM5DQ9BY66 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM5DQ9BY66 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM5DQ9BY66 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KDM5DQ9BY66 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM5DQ9BY66 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM5DQ9BY66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM5DQ9BY66 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM5DQ9BY66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
KDM5DQ9BY66 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
KDM5DQ9BY66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
KDM5DQ9BY66 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM5DQ9BY66 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM5DQ9BY66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KDM5DQ9BY66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM5DQ9BY66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM5DQ9BY66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM5DQ9BY66 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
KDM5DQ9BY66 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
KDM5DQ9BY66 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KDM5DQ9BY66 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
KDM5DQ9BY66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
KDM5DQ9BY66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
KDM5DQ9BY66 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5DQ9BY66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5DQ9BY66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KDM5DQ9BY66 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
KDM5DQ9BY66 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
KDM5DQ9BY66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms