Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCAR1Q9BXC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCAR1Q9BXC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR1Q9BXC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR1Q9BXC0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR1Q9BXC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR1Q9BXC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCAR1Q9BXC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCAR1Q9BXC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCAR1Q9BXC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCAR1Q9BXC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR1Q9BXC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR1Q9BXC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCAR1Q9BXC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCAR1Q9BXC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR1Q9BXC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCAR1Q9BXC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms