Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD1Q9BSK0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARVELD1Q9BSK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARVELD1Q9BSK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARVELD1Q9BSK0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARVELD1Q9BSK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARVELD1Q9BSK0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARVELD1Q9BSK0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARVELD1Q9BSK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARVELD1Q9BSK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD1Q9BSK0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARVELD1Q9BSK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARVELD1Q9BSK0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARVELD1Q9BSK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARVELD1Q9BSK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARVELD1Q9BSK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARVELD1Q9BSK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARVELD1Q9BSK0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms