Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSD3

RHNO1, RAD9, HUS1, RAD1-interacting nuclear orphan protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHNO1Q9BSD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHNO1Q9BSD3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHNO1Q9BSD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHNO1Q9BSD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHNO1Q9BSD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RHNO1Q9BSD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHNO1Q9BSD3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHNO1Q9BSD3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHNO1Q9BSD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHNO1Q9BSD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHNO1Q9BSD3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHNO1Q9BSD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHNO1Q9BSD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHNO1Q9BSD3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms