Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT3Q9BQG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT3Q9BQG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT3Q9BQG1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT3Q9BQG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT3Q9BQG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT3Q9BQG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYT3Q9BQG1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT3Q9BQG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms