Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3CQ99985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3CQ99985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3CQ99985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3CQ99985 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3CQ99985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3CQ99985 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3CQ99985 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3CQ99985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3CQ99985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3CQ99985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3CQ99985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3CQ99985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3CQ99985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3CQ99985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3CQ99985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3CQ99985 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms