Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRRX2Q99811 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRRX2Q99811 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRRX2Q99811 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PRRX2Q99811 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRRX2Q99811 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRRX2Q99811 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRRX2Q99811 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRRX2Q99811 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRRX2Q99811 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRRX2Q99811 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRRX2Q99811 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRRX2Q99811 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRRX2Q99811 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRRX2Q99811 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRRX2Q99811 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRRX2Q99811 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRRX2Q99811 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRRX2Q99811 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRRX2Q99811 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRRX2Q99811 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRRX2Q99811 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRRX2Q99811 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms