Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS1Q99742 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS1Q99742 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS1Q99742 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS1Q99742 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS1Q99742 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS1Q99742 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPAS1Q99742 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPAS1Q99742 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAS1Q99742 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPAS1Q99742 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS1Q99742 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS1Q99742 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS1Q99742 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms