Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD5Q99717 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD5Q99717 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD5Q99717 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD5Q99717 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD5Q99717 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD5Q99717 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD5Q99717 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD5Q99717 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SMAD5Q99717 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD5Q99717 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms