Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF18Q99633 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF18Q99633 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF18Q99633 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF18Q99633 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF18Q99633 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF18Q99633 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF18Q99633 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF18Q99633 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF18Q99633 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF18Q99633 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF18Q99633 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms