Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCL13Q99616 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL13Q99616 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL13Q99616 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL13Q99616 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL13Q99616 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL13Q99616 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL13Q99616 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL13Q99616 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCL13Q99616 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL13Q99616 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL13Q99616 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL13Q99616 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL13Q99616 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms