Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
SCAF11Q99590 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
SCAF11Q99590 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
SCAF11Q99590 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SCAF11Q99590 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SCAF11Q99590 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SCAF11Q99590 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SCAF11Q99590 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SCAF11Q99590 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
SCAF11Q99590 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
SCAF11Q99590 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SCAF11Q99590 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SCAF11Q99590 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SCAF11Q99590 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SCAF11Q99590 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SCAF11Q99590 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SCAF11Q99590 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SCAF11Q99590 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAF11Q99590 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SCAF11Q99590 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAF11Q99590 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SCAF11Q99590 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAF11Q99590 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SCAF11Q99590 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SCAF11Q99590 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SCAF11Q99590 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SCAF11Q99590 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SCAF11Q99590 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
SCAF11Q99590 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SCAF11Q99590 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SCAF11Q99590 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SCAF11Q99590 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF11Q99590 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SCAF11Q99590 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAF11Q99590 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAF11Q99590 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SCAF11Q99590 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SCAF11Q99590 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SCAF11Q99590 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SCAF11Q99590 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SCAF11Q99590 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SCAF11Q99590 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SCAF11Q99590 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SCAF11Q99590 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SCAF11Q99590 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
SCAF11Q99590 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SCAF11Q99590 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms