Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PIK3R4Q99570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PIK3R4Q99570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PIK3R4Q99570 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PIK3R4Q99570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PIK3R4Q99570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PIK3R4Q99570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PIK3R4Q99570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PIK3R4Q99570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PIK3R4Q99570 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PIK3R4Q99570 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PIK3R4Q99570 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PIK3R4Q99570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
PIK3R4Q99570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PIK3R4Q99570 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PIK3R4Q99570 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PIK3R4Q99570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PIK3R4Q99570 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PIK3R4Q99570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PIK3R4Q99570 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PIK3R4Q99570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PIK3R4Q99570 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
PIK3R4Q99570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PIK3R4Q99570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PIK3R4Q99570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PIK3R4Q99570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
PIK3R4Q99570 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PIK3R4Q99570 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PIK3R4Q99570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PIK3R4Q99570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PIK3R4Q99570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PIK3R4Q99570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PIK3R4Q99570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PIK3R4Q99570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PIK3R4Q99570 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PIK3R4Q99570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PIK3R4Q99570 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PIK3R4Q99570 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3R4Q99570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PIK3R4Q99570 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PIK3R4Q99570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms