Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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