Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG8Q96MW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG8Q96MW5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG8Q96MW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG8Q96MW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG8Q96MW5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG8Q96MW5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG8Q96MW5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG8Q96MW5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COG8Q96MW5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG8Q96MW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG8Q96MW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG8Q96MW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG8Q96MW5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG8Q96MW5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COG8Q96MW5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG8Q96MW5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG8Q96MW5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COG8Q96MW5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG8Q96MW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms