Protein–RNA interactions for Protein: Q96M86

DNHD1, Dynein heavy chain domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNHD1Q96M86 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNHD1Q96M86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNHD1Q96M86 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNHD1Q96M86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNHD1Q96M86 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNHD1Q96M86 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNHD1Q96M86 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNHD1Q96M86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNHD1Q96M86 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNHD1Q96M86 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNHD1Q96M86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNHD1Q96M86 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNHD1Q96M86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNHD1Q96M86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNHD1Q96M86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNHD1Q96M86 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNHD1Q96M86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNHD1Q96M86 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNHD1Q96M86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNHD1Q96M86 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms