Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRMT61AQ96FX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT61AQ96FX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT61AQ96FX7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT61AQ96FX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT61AQ96FX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT61AQ96FX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT61AQ96FX7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT61AQ96FX7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT61AQ96FX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT61AQ96FX7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT61AQ96FX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms