Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUB1Q96FW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTUB1Q96FW1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTUB1Q96FW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUB1Q96FW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUB1Q96FW1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUB1Q96FW1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUB1Q96FW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUB1Q96FW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB1Q96FW1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB1Q96FW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUB1Q96FW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUB1Q96FW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUB1Q96FW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUB1Q96FW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUB1Q96FW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
OTUB1Q96FW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUB1Q96FW1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms