Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFT43Q96FT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFT43Q96FT9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT43Q96FT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT43Q96FT9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT43Q96FT9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT43Q96FT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT43Q96FT9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT43Q96FT9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT43Q96FT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT43Q96FT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT43Q96FT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT43Q96FT9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT43Q96FT9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT43Q96FT9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT43Q96FT9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT43Q96FT9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT43Q96FT9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT43Q96FT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT43Q96FT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT43Q96FT9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT43Q96FT9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFT43Q96FT9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms