Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC97Q96F63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC97Q96F63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC97Q96F63 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC97Q96F63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC97Q96F63 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC97Q96F63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC97Q96F63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC97Q96F63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC97Q96F63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC97Q96F63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC97Q96F63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC97Q96F63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC97Q96F63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms