Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL53Q96EL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL53Q96EL3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL53Q96EL3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL53Q96EL3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL53Q96EL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL53Q96EL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL53Q96EL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL53Q96EL3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms