Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MALSU1Q96EH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MALSU1Q96EH3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MALSU1Q96EH3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MALSU1Q96EH3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MALSU1Q96EH3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MALSU1Q96EH3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MALSU1Q96EH3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MALSU1Q96EH3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MALSU1Q96EH3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MALSU1Q96EH3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MALSU1Q96EH3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MALSU1Q96EH3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms