Protein–RNA interactions for Protein: Q96D70

R3HDM4, R3H domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM4Q96D70 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM4Q96D70 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM4Q96D70 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM4Q96D70 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3HDM4Q96D70 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM4Q96D70 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
R3HDM4Q96D70 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM4Q96D70 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM4Q96D70 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HDM4Q96D70 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms