Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRAMD1AQ96CP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRAMD1AQ96CP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRAMD1AQ96CP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRAMD1AQ96CP6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRAMD1AQ96CP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRAMD1AQ96CP6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GRAMD1AQ96CP6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1AQ96CP6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRAMD1AQ96CP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRAMD1AQ96CP6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRAMD1AQ96CP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRAMD1AQ96CP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRAMD1AQ96CP6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1AQ96CP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1AQ96CP6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1AQ96CP6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1AQ96CP6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRAMD1AQ96CP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRAMD1AQ96CP6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRAMD1AQ96CP6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms