Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CHMP4CQ96CF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHMP4CQ96CF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHMP4CQ96CF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHMP4CQ96CF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHMP4CQ96CF2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHMP4CQ96CF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHMP4CQ96CF2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHMP4CQ96CF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMP4CQ96CF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHMP4CQ96CF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHMP4CQ96CF2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHMP4CQ96CF2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHMP4CQ96CF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHMP4CQ96CF2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMP4CQ96CF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHMP4CQ96CF2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHMP4CQ96CF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHMP4CQ96CF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHMP4CQ96CF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHMP4CQ96CF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHMP4CQ96CF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHMP4CQ96CF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHMP4CQ96CF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms