Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPTQ96BT3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPTQ96BT3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPTQ96BT3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPTQ96BT3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPTQ96BT3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPTQ96BT3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPTQ96BT3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPTQ96BT3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPTQ96BT3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPTQ96BT3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPTQ96BT3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPTQ96BT3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPTQ96BT3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPTQ96BT3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPTQ96BT3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPTQ96BT3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPTQ96BT3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPTQ96BT3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPTQ96BT3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms