Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMIGD2Q96BF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMIGD2Q96BF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMIGD2Q96BF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMIGD2Q96BF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMIGD2Q96BF3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMIGD2Q96BF3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMIGD2Q96BF3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMIGD2Q96BF3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMIGD2Q96BF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMIGD2Q96BF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIGD2Q96BF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms