Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3KBP1Q96B97 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3KBP1Q96B97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3KBP1Q96B97 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3KBP1Q96B97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3KBP1Q96B97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3KBP1Q96B97 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3KBP1Q96B97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3KBP1Q96B97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3KBP1Q96B97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3KBP1Q96B97 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms