Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NKD2Q969F2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NKD2Q969F2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NKD2Q969F2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NKD2Q969F2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKD2Q969F2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKD2Q969F2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NKD2Q969F2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NKD2Q969F2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NKD2Q969F2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NKD2Q969F2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NKD2Q969F2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms