Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCSTNQ92542 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCSTNQ92542 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCSTNQ92542 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NCSTNQ92542 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCSTNQ92542 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NCSTNQ92542 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCSTNQ92542 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCSTNQ92542 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCSTNQ92542 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCSTNQ92542 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCSTNQ92542 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms