Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SUSD6Q92537 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SUSD6Q92537 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUSD6Q92537 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SUSD6Q92537 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUSD6Q92537 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUSD6Q92537 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUSD6Q92537 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUSD6Q92537 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUSD6Q92537 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SUSD6Q92537 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUSD6Q92537 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUSD6Q92537 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUSD6Q92537 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SUSD6Q92537 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUSD6Q92537 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUSD6Q92537 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD6Q92537 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUSD6Q92537 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD6Q92537 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD6Q92537 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SUSD6Q92537 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD6Q92537 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SUSD6Q92537 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD6Q92537 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SUSD6Q92537 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SUSD6Q92537 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUSD6Q92537 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUSD6Q92537 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms