Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATRIPQ8WXE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATRIPQ8WXE1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATRIPQ8WXE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATRIPQ8WXE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATRIPQ8WXE1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATRIPQ8WXE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATRIPQ8WXE1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATRIPQ8WXE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATRIPQ8WXE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATRIPQ8WXE1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATRIPQ8WXE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATRIPQ8WXE1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATRIPQ8WXE1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATRIPQ8WXE1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATRIPQ8WXE1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms