Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHPT1Q8WUD6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHPT1Q8WUD6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHPT1Q8WUD6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPT1Q8WUD6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHPT1Q8WUD6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPT1Q8WUD6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPT1Q8WUD6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPT1Q8WUD6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPT1Q8WUD6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHPT1Q8WUD6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHPT1Q8WUD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHPT1Q8WUD6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHPT1Q8WUD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms