Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARB1Q8WTV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARB1Q8WTV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB1Q8WTV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB1Q8WTV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB1Q8WTV0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB1Q8WTV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB1Q8WTV0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARB1Q8WTV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARB1Q8WTV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARB1Q8WTV0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARB1Q8WTV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB1Q8WTV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms