Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCARB1Q8WTV0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCARB1Q8WTV0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARB1Q8WTV0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARB1Q8WTV0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARB1Q8WTV0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARB1Q8WTV0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARB1Q8WTV0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARB1Q8WTV0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARB1Q8WTV0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCARB1Q8WTV0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARB1Q8WTV0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCARB1Q8WTV0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCARB1Q8WTV0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARB1Q8WTV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARB1Q8WTV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCARB1Q8WTV0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCARB1Q8WTV0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARB1Q8WTV0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCARB1Q8WTV0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCARB1Q8WTV0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARB1Q8WTV0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCARB1Q8WTV0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARB1Q8WTV0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARB1Q8WTV0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCARB1Q8WTV0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARB1Q8WTV0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARB1Q8WTV0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARB1Q8WTV0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARB1Q8WTV0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARB1Q8WTV0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARB1Q8WTV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARB1Q8WTV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARB1Q8WTV0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARB1Q8WTV0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARB1Q8WTV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARB1Q8WTV0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARB1Q8WTV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARB1Q8WTV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARB1Q8WTV0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARB1Q8WTV0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARB1Q8WTV0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARB1Q8WTV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARB1Q8WTV0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARB1Q8WTV0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARB1Q8WTV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARB1Q8WTV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARB1Q8WTV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARB1Q8WTV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARB1Q8WTV0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARB1Q8WTV0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARB1Q8WTV0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARB1Q8WTV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARB1Q8WTV0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARB1Q8WTV0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCARB1Q8WTV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARB1Q8WTV0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCARB1Q8WTV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB1Q8WTV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARB1Q8WTV0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARB1Q8WTV0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARB1Q8WTV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARB1Q8WTV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARB1Q8WTV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARB1Q8WTV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARB1Q8WTV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARB1Q8WTV0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARB1Q8WTV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARB1Q8WTV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARB1Q8WTV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB1Q8WTV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARB1Q8WTV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARB1Q8WTV0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARB1Q8WTV0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARB1Q8WTV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARB1Q8WTV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARB1Q8WTV0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARB1Q8WTV0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARB1Q8WTV0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARB1Q8WTV0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARB1Q8WTV0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
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