Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3AQ8TCU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3AQ8TCU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3AQ8TCU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3AQ8TCU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3AQ8TCU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3AQ8TCU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3AQ8TCU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3AQ8TCU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3AQ8TCU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3AQ8TCU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN3AQ8TCU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3AQ8TCU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3AQ8TCU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIN3AQ8TCU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN3AQ8TCU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN3AQ8TCU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN3AQ8TCU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms