Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR48Q8TAF3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR48Q8TAF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR48Q8TAF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR48Q8TAF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR48Q8TAF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR48Q8TAF3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR48Q8TAF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR48Q8TAF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR48Q8TAF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR48Q8TAF3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR48Q8TAF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms