Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZFP28Q8NHY6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZFP28Q8NHY6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFP28Q8NHY6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZFP28Q8NHY6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFP28Q8NHY6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFP28Q8NHY6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZFP28Q8NHY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFP28Q8NHY6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFP28Q8NHY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFP28Q8NHY6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms