Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KNL1Q8NG31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNL1Q8NG31 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNL1Q8NG31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNL1Q8NG31 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNL1Q8NG31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNL1Q8NG31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KNL1Q8NG31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNL1Q8NG31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KNL1Q8NG31 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNL1Q8NG31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNL1Q8NG31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KNL1Q8NG31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KNL1Q8NG31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KNL1Q8NG31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNL1Q8NG31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNL1Q8NG31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNL1Q8NG31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNL1Q8NG31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms