Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF248Q8NDW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF248Q8NDW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF248Q8NDW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF248Q8NDW4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF248Q8NDW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF248Q8NDW4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF248Q8NDW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF248Q8NDW4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF248Q8NDW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF248Q8NDW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF248Q8NDW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF248Q8NDW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF248Q8NDW4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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