Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM1BQ8NB78 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM1BQ8NB78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM1BQ8NB78 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM1BQ8NB78 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM1BQ8NB78 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM1BQ8NB78 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM1BQ8NB78 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM1BQ8NB78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM1BQ8NB78 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM1BQ8NB78 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM1BQ8NB78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM1BQ8NB78 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM1BQ8NB78 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM1BQ8NB78 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms