Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KBTBD3Q8NAB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KBTBD3Q8NAB2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KBTBD3Q8NAB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KBTBD3Q8NAB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KBTBD3Q8NAB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KBTBD3Q8NAB2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KBTBD3Q8NAB2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KBTBD3Q8NAB2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KBTBD3Q8NAB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KBTBD3Q8NAB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KBTBD3Q8NAB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
KBTBD3Q8NAB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KBTBD3Q8NAB2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KBTBD3Q8NAB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KBTBD3Q8NAB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KBTBD3Q8NAB2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KBTBD3Q8NAB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KBTBD3Q8NAB2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KBTBD3Q8NAB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms