Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD1Q8N9F7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD1Q8N9F7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD1Q8N9F7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD1Q8N9F7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD1Q8N9F7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDPD1Q8N9F7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDPD1Q8N9F7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD1Q8N9F7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPD1Q8N9F7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDPD1Q8N9F7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPD1Q8N9F7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPD1Q8N9F7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms