Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC89Q8N998 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC89Q8N998 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC89Q8N998 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC89Q8N998 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC89Q8N998 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC89Q8N998 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC89Q8N998 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC89Q8N998 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC89Q8N998 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC89Q8N998 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC89Q8N998 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC89Q8N998 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC89Q8N998 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC89Q8N998 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms