Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAF1Q8N7H5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAF1Q8N7H5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAF1Q8N7H5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAF1Q8N7H5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAF1Q8N7H5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAF1Q8N7H5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAF1Q8N7H5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAF1Q8N7H5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAF1Q8N7H5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAF1Q8N7H5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAF1Q8N7H5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAF1Q8N7H5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAF1Q8N7H5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAF1Q8N7H5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAF1Q8N7H5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PAF1Q8N7H5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAF1Q8N7H5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PAF1Q8N7H5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms