Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf53Q8N6V4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf53Q8N6V4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C10orf53Q8N6V4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C10orf53Q8N6V4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C10orf53Q8N6V4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf53Q8N6V4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf53Q8N6V4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf53Q8N6V4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf53Q8N6V4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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